1905年3月7日，上海震旦公學140餘名學生全體退學，反對法人干預教育，“廢英文，重法文，教育各權皆掌之西教習”。震旦公學校董、近代教育家馬相伯支持學生的正義行為，宣佈出資創辦復旦公學，“復旦”兩字由學校創始人、中國近代知名教育家馬相伯先生，選自《尚書大傳.虞夏傳》中“日月光華，旦復旦兮”的名句。1905年5月27日，私立復旦公學成立。
復旦大學是全國重點大學。全校擁有人文學院、新聞學院、法學院、經濟學院、管理學院、技術科學與工程學院、生命科學學院等7個學院。根據國家教育部的專業調整，學校現設有34個系，48個本科專業，100個碩士學位點，50個博士學位點，並設有數學、物理學、化學、生物學、哲學、應用經濟學、理論經濟學、歷史學、中國語言文學、新聞傳播學、管理科學、電子科學與技術、計算機科學與技術、力學、工商管理等15個博士後科研流動站，有10個一級學科具有博士學位授予權，有16個學科被國家教育部批准為全國重點學科，數學、物理、化學、生物、中文、歷史、哲學、經濟等8個本科專業被定為國家基礎科學研究和教學人才培養基地。此外，學校還設有36個研究所、46個跨系科多學科的研究中心及研究生院、成人教育學院、國際文化交流學院。
復旦大學以“博學而篤志，切問而近思”為校訓，以“文明、健康、團結、奮發”為校風，以“刻苦、嚴謹、求實、創新”為學風，素有“江南第一學府”及“學在復旦”之聲譽。復旦大學學生繼承了優良的傳統，學習刻苦，思想活躍。
復旦大學已建立校董會。在歷史上，包括中國革命先行者孫中山先生在內的許多知名人士都曾出任“復旦校董”。

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